total descendants::2 total children::1 2 ❤️ |
Aj keď si odmyslíme ten problém s “bežný” vs “nový”, tak s interpretáciou toho čísla sú tam dva ďalšie problémy. Prvý problém je, že vírusy rastú exponenciálne a ich growth rate (r) je definovaný ako r=Δ(log(N(t)))/Δt, kde log(N(t)) je prirodzený logaritmus počtu virálnych častíc v čase t. Takže ak po 24 hodinách nameráme v bunkovej kultúre s kmeňom A 270-krát viac častíc vírusu ako v bunkovej kultúre s kmeňom B, tak growth rate kmeňa A nie je 270-krát väčší, ale iba log(270)=5.6-krát väčší (edit: viď koment dole od id ziman). Druhý problem spočíva v ambiguite pojmu “rýchlosť množenia”. Možné interpretácie sú minimálne dve. - Prvá interpretácia je tá, s ktorou narábam ja v príklade hore a s ktorou narábali ľudia v tom článku, kde namerali 270-krát vyšší viral load. Tá interpretácia je, že ide o rýchlosť celkovej produkcie infekčných vírusových častíc. Toto číslo zahŕňa veľké množstvo čiastkových procesov ako napríklad afinita k receptoru hostiteľskej bunky, rýchlosť vniku do bunky, rýchlosť kopírovania genetickej informácie, rýchlosť skladania viriónov atď. Rozdiely medzi kmeňmi v hociktorom z týchto parametrov sa odzrkadia aj na celkovej rýchlosti produkcie virálnych častíc. - Druhá interpretácia, s ktorou narába implicitne peková je, že ide o ten čiastkový proces, ktorý som v odstavci vyššie označil ako “rýchlosť kopírovania genetickej informácie” ie rýchlosť s ktorou sa kopíruje RNA vírusu. Ona sa sústreďuje na rýchlosť kopírovania RNA, lebo práve tá oblasť, ktorú ona označuje ako “velín”, u iných koronavírusov kontroluje rýchlosť replikácie. Tie “podozrivé” mutácie ktoré vo velíne našla podľa nej zvyšujú rýchlosť replikácie, ale to je ničím nepodložené tvrdenie. Tie mutácie môžu rýchlosť replikácie pokojne znižovať (môj tip by bol že budú neutrálne). Každopádne ten problém je, že vyššiu rýchlosť produkcie virálnych častíc ona interpretuje ako vyššiu rýchlosť replikácie RNA. To je ale falošná implikácia. Vyššia rýchlosť množenia môže pokojne súvisieť s vyššou afinitou vírusu k bunkovým receptorom (alebo desiatkou ďaľších procesov) a s velínom nemať nič spoločné. |
| |||||||||||||||||||||||||