v Prahe sa dá robiť doktorantúra v etnológii tu: http://etnologie.ff.cuni.cz/ (vyštudoval som tam, takže sa kľudne prípadne pýtaj, ale PhD som tam nerobil)
a nejakí doktoranti sú aj tu, ale predpokladám, že najprv museli byť prihlásení na doktorantúru niekde na univerzite, aby mohli v akadémii pracovať (ale to sa len tak domnievam): http://www.eu.cas.cz/